التحدي المتمثل في معالجة السموم الفطرية في الدواجن
يمكن أن يؤدي وجود السموم الفطرية إلى تثبيط المناعة في الدواجن ، وبالتالي التأثير على كفاءة التطعيم ، ويمكن أن تؤدي السموم أيضًا إلى ظهور تأثيرات مرضية مختلفة مثل تسمم الكبد والكلى ، وكذلك تظهر استجابات الاستروجين - وكلها ضارة للغاية ، ليس فقط للطيور ، ولكن أيضًا لقطعان الامهات وقطعان الجدات
على وجه التحديد ، تؤدي السموم الفطرية إلى تفاقم العدوى بالكوكسيديا وحتى الاسبيريجللس في جميع أنواع الدواجن. يظهر تزيد نسبة الاصابة بالتهاب الأمعاء التنكرزي في الدجاج اللاحم عند وجود السموم الفطرية ، على سبيل المثال دون أو فومونيزينات في العلف ، حتى عند الجرعات المنخفضة
أخذ العينات غير الصحيحة بسبب حدوث النقاط الساخنة ) اماكن معينة لنمو ووجود السموم الفطرية)
السموم الفطرية المقنعة او المتخفية - السموم الفطرية المرتبطة بمكونات العلف ، مثل السكريات ، ولاتظهر في التحليلات ولكنها تظل سامة للطيور
لا يتم تحليل السموم الفطرية الناشئة بشكل روتيني ، ولا سيما تلك الموجودة في السيلاج